毛利小五郎其實早就看透了柯南的身份，但一直沒有說出來。

在TV版第890集中，毛利小五郎已經完全暴露了他知道柯南利用他破案的事實。柯南利用變聲器假扮毛利小五郎打電話套路堆放，誰知道被毛利小五郎聽到。

但是毛利小五郎沒有驚訝，也沒有特別生氣，只是說一句：喂，下回再讓我看見你用我的大名招搖撞騙，我就讓你知道我的厲害。很明顯這句話沒有什么用。緊接著，小五郎就被射了安眠針破解了這件案子，最后還說了這么一句話：“又在不知不覺中完美破案！”

可見他對這些事情習以為常，甚至都養成了習慣，每次中了麻醉針都擺姿勢外睡過去。所以可以說毛利小五郎其實早就看透了柯南的身份，只是在假裝不知道而已。